設立行政訴訟調解制度，探索適合行政訴訟特點的最佳程序結構模式，首先應針對行政訴訟的特殊性，同時要借鑒民事訴訟調解制度的成功經驗和做法。

1、行政訴訟調解基本原則

⑴合法原則。相對于民事訴訟來說，行政訴訟調解的合法原則更為重要。行政訴訟調解的合法原則應包括兩個方面：一是調解協議的內容不得違反法律、法規的禁止性原則;二是調解協議的內容不得損害國家利益、公共利益和他人的合法權益。行政訴訟的根本目的是通過監督行政主體的依法行政來保護相對人的合法權益，監督和保護的功能是辨證統一的。這就要求在行政訴訟的調解中，人民法院不能為了換取相對人接受調解的條件而放任行政主體超越或放棄其行政職權，以行政權作交易，也不能站在行政主體的立場上壓制相對人。既要平等保護各方當事人，又不能損害國家利益。公共利益和他人的合法利益。

⑵當事人自愿原則。自愿原則是行政訴訟調解的本質屬性和核心原則。人民法院在審理行政案件時，應根據當事人自愿原則，在查明事實、分清是非、明確責任的基礎上，說服當事人互諒互讓，依照法律、法規及有關政策的規定，讓雙方當事人自愿達成協議解決爭端，進行調解。

⑶調審結合原則。訴訟中調解往往以一方放棄部分權利為代價，行政訴訟的目的是維護公民、法人和其他組織的合法權益，監督、支持行政主體依法行政。行政訴訟調解也應象民事調解、刑事附帶民事調解和行政賠償訴訟調解一樣，選擇調審結合模式，不論是審前還是審判中，堅持能調則調，當判則判，妥善解決行政糾紛。

⑷傾向原告原則。訴訟制度強調訴訟主體的平等對抗，但在行政管理關系中，在行政強權下，原告處于先天的弱勢地位。故行政訴訟調解制度在設立上應加大對原告訴訟權力的設置，通過行政訴訟的制度設計讓原告與被告能達到一種相抗衡的狀態。

2、行政訴訟調解的程序及操作

⑴調解程序的啟動方式

對可適用調解的案件，調解程序的啟動分兩種方式：一是依職權調解。法院可以根據案件具體情況，出于對原告利益的考慮，可主動進行調解，提出調解方案供當事人參考;二是依申請調解。當事人在自愿的基礎上，在法定期限內申請人民法院對案件進行調解并提出調解方案。

⑵限制調解期限

具體行政行為是否合法決定著行政訴訟案件能否適用調解，因此，行政訴訟的調解只能在法院對具體行政行為是否合法作出明確判斷的庭審中或庭審后判決前的階段中，而不能適用于判決前的各個階段，這點應與民事訴訟相區別。行政訴訟的調解只能在庭審中或庭審后判決前的兩個階段中進行。為防止案件久調不決，以拖壓調，應對調解的次數作出限制。為了與調解的階段相協調，調解的次數不應超過兩次。在法定的調解期限內不能達成調解協議的，主持調解的法官應終結調解程序，及時判決。用以督促法官及時、高效的處理案件。

⑶調解的法律后果。

肯定的調解后果。當事人雙方在遵循行政訴訟調解原則的基礎上達成合議，調解即告成立，法院應依據調解協議制作調解書，送達當事人雙方簽字，調解書自雙方當事人簽字后生效。當事人在調解中達成的調解內容有關事項的妥協意見，不得在其后的訴訟中作為對其不利證據。調解書生效后，當事人一般都能自動履行，在當事人不自動履行調解書所確定的義務時，若調解書有給付內容，應賦予調解書強制執行力。但調解書送達后與生效的判決書一樣，當事人即喪失了上訴權。

否定的調解后果。對于調解也有必要建立相應的救濟制度即反悔權制度。雖調解協議在自愿基礎上促成，但調解書送達前或送達時當事人拒絕簽收的，調解書不發生法律效力，法院要及時通知其他當事人，對案件及時審理宣判。調解書送達后，如原告確有證據證明調解時受到欺詐、脅迫等違反調解自愿原則或協議內容違法的，應賦予原告申請再審的權利。當事人在主審法官的主持下，自始就沒有達成合議，調解不成立，法院應當恢復審理，及時宣判。