根據(jù)第八屆全國人民代表大會第一次會議批準(zhǔn)的國務(wù)院機構(gòu)改革方案，保留審計署。按照轉(zhuǎn)變職能，理順關(guān)系，精兵簡政，提高效率的原則和黨的十四大關(guān)于強化審計監(jiān)督的精神，確定審計署的職能配置、機構(gòu)設(shè)置和人員編制。

　　一、職能轉(zhuǎn)變

　　審計署職能轉(zhuǎn)變的重點是：強化審計監(jiān)督職能，維護國家財經(jīng)法規(guī)，監(jiān)督國家資金的管理和使用，充分發(fā)揮其在國民經(jīng)濟宏觀管理中的作用；按照統(tǒng)一領(lǐng)導(dǎo)、分級審計的原則，加強對國務(wù)院各部門特別是經(jīng)濟管理部門和省級人民政府財政收支的直接審計。減少統(tǒng)一部署的審計項目，地方的審計項目一般由地方審計機關(guān)根據(jù)政府的要求自行安排；改革企業(yè)審計辦法，減少對企業(yè)的直接審計，重點審計占有、使用國有資產(chǎn)數(shù)額較多和接受國家財政補貼較多的中央部屬國有企業(yè)，對其他中央部署國有企業(yè)逐步改為由審計事務(wù)所、會計師事務(wù)所進行審計，審計機關(guān)在必要時進行抽審。

　　二、主要職責(zé)

　　依據(jù)憲法規(guī)定，審計署對國務(wù)院各部門和地方各級人民政府的財政收支，對國家的財政金融機構(gòu)和企事業(yè)組織的財務(wù)收支，進行審計監(jiān)督。

　　根據(jù)《中華人民共和國審計條例》的規(guī)定，審計監(jiān)督工作實行統(tǒng)一領(lǐng)導(dǎo)、分級審計的原則。審計署的主要職責(zé)是：

　　（一）組織領(lǐng)導(dǎo)全國的審計工作，研究制訂審計法律、法規(guī)和審計工作的方針、政策，確定工作重點，制定審計業(yè)務(wù)規(guī)章制度，組織某些行業(yè)和專項資金審計。

　　（二）直接進行下列審計：1.國務(wù)院各部門和接受中央財政撥款單位的財政、財務(wù)收支及其資金使用效益。

　　2.國務(wù)院各部門和省級人民政府預(yù)算外財政資金的收支及其使用效益。

　　3.國家金融機構(gòu)信貸計劃的執(zhí)行及其結(jié)果。

　　4.國務(wù)院管理的經(jīng)濟實體和部委歸口管理、財務(wù)單列經(jīng)濟實體的盈虧真實和國有資產(chǎn)的保值增值。

　　5.國家重點建設(shè)項目的資金來源、使用情況和經(jīng)濟效益。

　　6.省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市的財政收支。

　　7.國務(wù)院各部門、經(jīng)濟實體、專業(yè)銀行和省、自治區(qū)、直轄市、計劃單列市借用的國外資金和使用的國外援助資金。

　　8.國家計劃、金融部門對社會集資和債券發(fā)行的審批情況。

　　（三）組織駐國務(wù)院各部門和駐地方派出機構(gòu)，對國務(wù)院各部門、經(jīng)濟實體所屬的企事業(yè)組織（包括有國有資產(chǎn)的中外合資經(jīng)營企業(yè)、中外合作經(jīng)營企業(yè)、國內(nèi)聯(lián)營企業(yè)和其他企業(yè)），國家金融機構(gòu)的分支機構(gòu)，國家重點建設(shè)項目等進行審計。

　　（四）處理地方被審計單位對省級審計機關(guān)審計決定的申訴。

　　（五）協(xié)同地方辦理省級審計機關(guān)負責(zé)人的任免事項。

　　（六）對審計中發(fā)現(xiàn)宏觀管理方面的問題，進行專題審計并向國務(wù)院反映情況，提出建議。

　　（七）指導(dǎo)和監(jiān)督注冊審計師協(xié)會和審計事務(wù)所。

　　（八）指導(dǎo)內(nèi)部審計工作。

　　（九）組織開展審計領(lǐng)域的國際交流活動。

　　（十）承辦國務(wù)院交辦的其他審計事項。

　　三、內(nèi)設(shè)機構(gòu)

　　根據(jù)上述職責(zé)，審計署設(shè)14個職能司和機關(guān)黨委。

　　（一）辦公廳負責(zé)政策研究，草擬、修改重要文件，反映情況，編輯內(nèi)部刊物、審計信息，承擔(dān)對外宣傳和文書、檔案、信訪工作，負責(zé)同駐部門、地方派出機構(gòu)進行聯(lián)系和機關(guān)行政管理等工作。

　　（二）綜合司負責(zé)編制署機關(guān)和派駐機構(gòu)的審計工作計劃，匯編全國審計工作計劃和審計工作統(tǒng)計報表；劃分審計范圍，協(xié)調(diào)各業(yè)務(wù)司和派駐機構(gòu)的審計事項；管理審計事業(yè)經(jīng)費；對署所屬單位的財務(wù)收支進行審計等工作。

　　（三）法規(guī)司負責(zé)草擬審計法規(guī)，復(fù)核重大審計事項決定，參與研究財政經(jīng)濟法規(guī)等工作。

　　（四）財政審計司負責(zé)審計省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市的預(yù)算收支和預(yù)算外財政資金的收支及其使用效益以及地方財稅管理情況。

　　（五）金融審計司負責(zé)審計國家金融機構(gòu)信貸計劃的執(zhí)行及其結(jié)果。根據(jù)署的計劃，具體組織駐地方派出機構(gòu)對國家金融機構(gòu)在地方的分支機構(gòu)和各地區(qū)、有關(guān)部門的債券發(fā)行、社會集資審批進行審計。

　　（六）行政事業(yè)審計司負責(zé)審計國務(wù)院政法、文教等部門和直屬機構(gòu)、辦事機構(gòu)、事業(yè)單位的財政、財務(wù)收支及其資金使用效益。根據(jù)署的計劃，具體組織駐部門、地方派出機構(gòu)對這些部門管理的某些專項資金進行審計。

　　（七）工業(yè)交通審計司負責(zé)審計國務(wù)院工業(yè)、交通部門和所屬經(jīng)濟實體、部委歸口管理財務(wù)單列經(jīng)濟實體的財政、財務(wù)收支及其經(jīng)濟效益和國有資產(chǎn)的保值增值。根據(jù)署的計劃，具體組織駐部門、地方派出機構(gòu)對工業(yè)、交通部門的直屬單位進行某些行業(yè)審計、專項資金審計和專題審計調(diào)查。

　　（八）商貿(mào)審計司負責(zé)審計國務(wù)院國內(nèi)貿(mào)易、對外貿(mào)易經(jīng)濟合作等部門和所屬經(jīng)濟實體、部委歸口管理財務(wù)單列經(jīng)濟實體的財政、財務(wù)收支及其經(jīng)濟效益和國有資產(chǎn)的保值增值。根據(jù)署的計劃、具體組織駐部門、地方的派出機構(gòu)對內(nèi)貿(mào)、外貿(mào)部門的直屬單位進行某些行業(yè)審計、專項資金審計和專題審計調(diào)查。

　　（九）固定資產(chǎn)投資審計司負責(zé)審計國務(wù)院各部門管理的固定資產(chǎn)投資、施工企業(yè)的財務(wù)收支及其經(jīng)濟效益。根據(jù)署的計劃，具體組織駐地方派出機構(gòu)對國家重點建設(shè)項目的資金來源、使用情況和經(jīng)濟效益進行審計。

　　（十）農(nóng)業(yè)審計司負責(zé)審計國務(wù)院農(nóng)業(yè)、林業(yè)、水利部門的財政、財務(wù)收支及其資金使用效益。根據(jù)署的計劃，具體組織駐部門、地方派出機構(gòu)和地方審計機關(guān)對農(nóng)業(yè)、林業(yè)、水利部門管理的某些專項資金進行審計和專題審計調(diào)查。

　　（十一）外資運用審計司負責(zé)審計國務(wù)院各部門和省、自治區(qū)、直轄市和計劃單列市借用的國外資金和使用的國外援助資金。根據(jù)署的計劃，具體組織駐地方派出機構(gòu)和地方審計機關(guān)對世界銀行、亞洲開發(fā)銀行等國際金融組織的貸款項目進行審計。

　　（十二）審計管理司負責(zé)對地方審計工作的檢查；指導(dǎo)內(nèi)部審計工作；通過注冊審計師協(xié)會指導(dǎo)、監(jiān)督審計事務(wù)所和注冊審計師的工作。

　　（十三）人事教育司負責(zé)辦理署機關(guān)、派出機構(gòu)、事業(yè)單位的干部調(diào)配、任免、工資福利、專業(yè)技術(shù)職稱考評；同地方協(xié)商省級審計機關(guān)負責(zé)人的任免事項；編制審計系統(tǒng)的干部教育規(guī)劃，指導(dǎo)干部培訓(xùn)工作。

　　（十四）外事司負責(zé)辦理署機關(guān)及直屬單位人員出國考察、訪問的有關(guān)事項，接待外國審計機關(guān)來訪團組，組織專家講學(xué)，同外國審計機關(guān)、國際審計組織進行聯(lián)系。

　　（十五）機關(guān)黨委負責(zé)署機關(guān)和在京直屬單位的黨群工作。

　　四、駐國務(wù)院各部門派出機構(gòu)

　　審計署在國務(wù)院三十七個部門設(shè)立審計派出機構(gòu)，根據(jù)署的授權(quán)，負責(zé)審計所在部門在京的直屬企事業(yè)組織（少數(shù)部門審計全系統(tǒng)的直屬企事業(yè)組織）的財務(wù)收支，調(diào)查行業(yè)經(jīng)濟效益，指導(dǎo)行業(yè)的內(nèi)部審計工作。駐部門派出機構(gòu)，實行審計署和駐在部門雙重領(lǐng)導(dǎo)，以審計署領(lǐng)導(dǎo)為主的體制。

　　五、人員編制和領(lǐng)導(dǎo)職數(shù)

　　審計署機關(guān)行政編制為475名，駐國務(wù)院各部門派出機構(gòu)行政編制為369名（另有45名事業(yè)編制），共844名。其中，審計長1名，副審計長4名，現(xiàn)有超配的1名副審計長，作為過渡，調(diào)離或退下來后不再增補。司級領(lǐng)導(dǎo)職數(shù)47名（含機關(guān)黨委專職副書記2名；財政、金融、固定資產(chǎn)投資審計司3個司按1正3副配備）。駐國務(wù)院各部門派出機構(gòu)司級領(lǐng)導(dǎo)職數(shù)，平均按1正1副配備。

　　經(jīng)檢、監(jiān)察等派駐機構(gòu)和后勤、老干部服務(wù)機構(gòu)及編制，按有關(guān)規(guī)定另行核定。